Transeksüel sendromu, dünya çapında üniversite hastaneleri tarafından tedavi edilen, doğuştan olan tıbbi bir durumdur. Annenin dölyatağında şekillenen fiziksel (organik) bir durumdur. Tüm memelilerde yavrunun başlangıçtaki cinsiyeti dişidir. Rahimdeki gelişimin 2. ayında, ceninin salgıladığı hormanlarla, bebeğin cinsiyeti ya dişi olarak kalır ya da erkeğe dönüşür. Bu dönemde o küçücük gövdenin ve beynin cinsel yapısı belirlenmiş olur. Bu durum erkeklerin de neden orjinal dişi cinsiyetin izi olarak kalan meme başlarına sahip olduğunu açıklar.
Transeksüellik, bir kişinin kendi cinsiyet kimliğini ve cinsiyet ifadesini doğru olarak hissettiği, biyolojik cinsiyetiyle örtüşmeyen bir cinsiyet kimliği deneyimlemesini ifade eder.
Bir kişi transeksüel olarak tanımlanıyorsa, bu kişi genellikle kendini karşı cins olarak tanımlar. Örneğin, bir biyolojik erkek, kendini kadın olarak tanımlıyorsa ve kadın cinsiyet ifadesini benimseyip cinsiyet değiştirme süreçleri (hormon tedavisi, cinsiyet değiştirme ameliyatları vb.) geçiriyorsa, bu kişi bir transeksüel olarak kabul edilir.
Transeksüellik, cinsiyet kimliği ve cinsiyet ifadesi ile ilgilidir ve cinsel yönelimle (kişi hangi cinsiyetten hoşlandığı) karıştırılmamalıdır. Transeksüel bireyler, heteroseksüel, homoseksüel, biseksüel veya başka herhangi bir cinsel yönelime sahip olabilirler.
Toplumlar ve yasalar transeksüel bireylerin haklarını ve tanımlarını farklı şekillerde ele alabilir. Birçok ülke, transeksüel bireylerin cinsiyet değiştirme süreçlerini yasal olarak tanır ve bu bireylere cinsiyet kimliğine uygun yaşam hakları tanır. Ancak toplumsal kabul ve ayrımcılıkla mücadele konusunda hala pek çok zorlukla karşılaşılmaktadır. Transeksüel bireylere saygı göstermek ve desteklemek, onların yaşamlarını daha sağlıklı ve mutlu bir şekilde sürdürmelerine yardımcı olabilir.
Ceninin gelişiminin tam bu aşamasında birşeyler yanlış gider ve bebeğin gövdesinin cinsiyeti ile beynin cinsiyeti aynı olmaz, yani gövde cinsel dönüşümünü yaparken beyin değişmeden dişi kalır, ya da beyin dönüşümünü yaparken beden dönüşmeden dişi kalır. Beyin üzerinde yapılan araştırmalar bu açıklamayı doğrular. Transeksüel doğmuş kişilerde yapılan otopsilerde beynin cinsiyetinin, doğduğundaki cinsiyeti ile aynı olmadığı görülmüştür. (Beynin bir bölümü erkeklerde ve dişilerde farklıdır.)
